一、妊娠相关情况
如果有正常性生活且未采取避孕措施，怀孕后可能出现腹痛但月经不来的情况。受精卵着床时可能有轻微腹痛，随着妊娠进展，子宫增大也可能引起腹部不适。育龄期有性生活史的女性出现这种情况，首先应考虑妊娠可能，可通过验孕试纸或到医院进行血hCG检测来明确。
二、内分泌失调
长期精神压力大、生活不规律等可能导致内分泌失调，影响激素分泌，从而出现肚子疼但月经不来的现象。例如多囊卵巢综合征患者，常伴有月经紊乱、腹痛等症状，这是由于体内雄激素水平升高、排卵异常等原因引起，可通过激素六项等检查来判断内分泌状况。
三、妇科疾病影响
一些妇科疾病也会导致这种情况，如子宫内膜异位症，异位的子宫内膜会在盆腔等部位生长，引起腹痛，同时影响月经周期导致月经不来。还有盆腔炎，炎症刺激可能造成下腹部疼痛，并且干扰月经的正常来潮，可通过妇科超声等检查辅助诊断。
四、其他因素
过度节食减肥、剧烈运动等也可能影响月经周期，导致肚子疼但月经不来。过度节食使身体营养摄入不足，影响激素合成；剧烈运动可能改变身体的内分泌平衡和生理状态，从而出现月经异常及腹痛表现。