甲基丙二酸血症患者的存活时间存在较大个体差异，受到多种因素影响。
影响存活时间的因素
发病年龄：新生儿期发病的患者病情往往较为严重，预后相对较差。例如，一些在新生儿期就出现严重代谢性酸中毒、酮症、低血糖等表现的患儿，若未及时得到有效治疗，可能在婴儿期甚至新生儿期就面临生命危险；而稍大年龄发病的患者，病情进展相对缓慢，存活时间可能相对长一些。
分型：甲基丙二酸血症有不同的分型，如维生素B12缺乏型相对对维生素B12治疗反应较好，病情控制相对理想，存活时间可能较长；而单纯甲基丙二酸血症型等可能病情较重，预后较差。
治疗依从性：患者能否严格遵循饮食控制等治疗方案对存活时间影响较大。如果患者能严格限制蛋白质摄入，保证足够的热量供应，维持体内甲基丙二酸等代谢产物在正常范围，病情控制较好，存活时间会相对长；反之，若不遵医嘱，可能导致病情反复加重，影响存活时间。
是否及时规范治疗：早期诊断并及时给予规范治疗，包括饮食治疗、维生素B12等药物治疗以及必要时的对症支持治疗，能够有效控制病情进展，改善预后，延长存活时间；如果诊断不及时，错过最佳治疗时机，会严重影响患者预后，缩短存活时间。
总体来说，部分甲基丙二酸血症患者经过积极规范治疗，可以存活较长时间，甚至接近正常人的寿命，但也有部分患者病情严重，存活时间较短。对于患儿，家长需要密切配合医生进行长期管理，关注患儿生长发育等情况，尽可能提高患儿的生活质量，延长存活时间。