三肽胶原蛋白一般情况下安全性较好，但部分人群可能出现以下情况：
过敏反应：少数对胶原蛋白过敏的人群使用含有三肽胶原蛋白的产品后可能出现过敏症状，如皮肤瘙痒、红斑、皮疹，严重者可能出现呼吸困难等过敏反应。有过敏体质尤其是对蛋白质过敏的人群需要格外谨慎，使用前可先进行小面积皮肤测试观察是否有异常反应。
胃肠道不适：过量摄入可能加重胃肠道负担，引起消化不良、腹胀等症状。对于胃肠功能较弱的人群，如本身患有慢性胃炎、胃溃疡等疾病的人，大量摄入含三肽胶原蛋白的产品可能会导致不适症状加重，因为胃肠道需要消化和吸收这些物质，过多的摄入超出了胃肠正常的消化能力范围。
与药物相互作用风险：如果正在服用其他药物，三肽胶原蛋白可能与某些药物发生相互作用。例如，可能影响药物的吸收、代谢等，但目前相关研究相对有限，具体的相互作用机制和情况还需进一步深入研究确认。对于正在长期服用药物的人群，在使用含三肽胶原蛋白产品前最好咨询医生，以评估可能存在的相互作用风险。
特殊人群需谨慎
-孕妇和哺乳期女性：目前关于孕妇和哺乳期女性摄入三肽胶原蛋白对母婴影响的研究还不够充分，为了安全起见，这类特殊人群应在医生指导下谨慎使用，因为需要综合考虑三肽胶原蛋白对胎儿发育或婴儿健康可能产生的潜在影响，目前缺乏足够的循证依据表明其绝对安全。
-儿童：儿童处于生长发育阶段，其消化系统、免疫系统等尚未完全成熟，目前针对儿童摄入三肽胶原蛋白的安全性和适宜剂量等方面的研究较少，不建议儿童随意摄入三肽胶原蛋白相关产品，以免出现未知的健康风险。