卵黄囊是胚胎发生体褶后，原肠则明显地分成胚内的原肠和胚外的卵黄囊，内包有大量的卵黄，卵黄囊的壁由胚外内胚层和胚外中胚层形成。如果第一次做B超时看到了卵黄囊，第二次做B超却没有了，可能是以下原因导致的。
1.超声技术的局限性：虽然超声是一种常用的医学检查方法，但它并不是100%准确的。在某些情况下，卵黄囊可能被误认为不存在，或者由于胎儿的位置、姿势或其他因素而无法被检测到。
2.胚胎发育异常：如果卵黄囊在第一次B超后没有继续发育，或者出现了其他异常，可能意味着胚胎存在问题。这可能是由于染色体异常、基因突变或其他遗传因素引起的。
3.自然流产：在某些情况下，卵黄囊可能会在怀孕早期自然消失，这可能是由于胚胎发育不良或其他原因导致的自然流产。
4.测量误差：卵黄囊的大小和形态可能会因测量者的不同而有所差异。如果两次测量的时间间隔较短，或者测量方法不同，可能会导致结果的差异。
需要注意的是，以上只是一些可能的原因，具体情况需要根据患者的具体情况和医生的进一步检查来确定。如果您对B超结果有任何疑问或担忧，建议及时咨询医生，以便进行进一步的检查和诊断。
在这种情况下，医生可能会建议进行其他检查，如血液检查、孕酮测定、绒毛活检等，以确定胚胎的发育情况。如果胚胎发育异常，医生可能会建议终止妊娠。如果胚胎发育正常，医生可能会建议继续观察，并在适当的时候进行进一步的超声检查。
此外，在怀孕期间，孕妇应该注意休息，避免过度劳累和剧烈运动，保持良好的心态，避免紧张和焦虑。同时，应该按照医生的建议进行产前检查，及时发现和处理任何问题。