先兆流产的原因有很多，主要有胚胎本身的异常，母体的原因，父亲的原因，如精子的问题；有毒、有害环境的影响。胚胎引起先兆流产的主要原因是胚胎的染色体异常，大部分自然淘汰以后就会流产，通过保胎也不行；母体的原因的包括有母体的全身性疾病，如高热、甲状腺疾病、黄体功能不全等。其次还有可能是生殖器官的异常，如纵隔子宫、子宫内膜息肉、肌瘤。还有宫颈内口机能不全，这部分患者因为宫口特别松，所以怀孕到一定的程度就可能会引起宫口开大而引起先兆流产的症状；父亲的方面的原因主要是精子质量的问题。如果精子的质量有异常，如染色体有异常的情况，大部分也可能会导致流产。母体的因素经过相应的处理，大部分可以继续妊娠。对于接触有毒、有害的环境、物质以后导致的胚胎受损，如果严重也会导致流产，如果不严重，在离开有毒、有害的环境以后经过适当的处理，可能可以继续怀孕。
