肛门发痒可能由多种原因引起，比如据相关统计，约有1/3的肛门瘙痒症与肛肠疾病相关。
局部皮肤病变导致
肛周湿疹：这是常见原因之一，多因局部潮湿、过敏等因素引发。患者肛周皮肤会出现红斑、丘疹、水疱等，伴有剧烈瘙痒，搔抓后可能渗出、结痂。肛门尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒感染所致，病变部位会出现乳头状、菜花状赘生物，也会引起肛门发痒，且具有传染性。
肛肠疾病引发
痔疮：尤其是外痔，痔核脱出后会刺激肛周皮肤，导致分泌物增多，从而引起肛门发痒。当痔疮出现炎症时，瘙痒会更明显。肛瘘：肛瘘外口会不断有脓性、血性分泌物溢出，刺激肛周皮肤，引发瘙痒，同时还可能伴有肛周反复肿痛等症状。
寄生虫感染因素
蛲虫感染：多见于儿童，夜间雌虫会爬出肛门产卵，刺激肛周皮肤，导致剧烈瘙痒，尤其在夜间更为明显，可在肛周发现白色细小线虫。疥螨感染：疥螨可寄生在人体皮肤表层，在肛门周围皮肤也可能寄生，引起局部瘙痒，皮肤可能出现丘疹、隧道等表现。
全身性疾病影响
糖尿病：糖尿病患者血糖控制不佳时，尿液中含糖量升高，会刺激肛周皮肤，容易引发瘙痒。同时，糖尿病患者免疫力相对较低，也更容易发生感染导致肛门发痒。肝胆疾病：如黄疸患者，由于血液中胆盐含量升高，会刺激神经末梢，引起全身瘙痒，包括肛门部位。