结膜充血的治疗需根据不同病因来进行。一般来说，针对感染性因素导致的结膜充血，若是细菌感染引起，可使用抗生素类眼药水，如氧氟沙星滴眼液等；若是病毒感染引起，可使用抗病毒类眼药水，如阿昔洛韦滴眼液等。而对于非感染性因素，如过敏导致的结膜充血，可使用抗过敏眼药水，如色甘酸钠滴眼液等。
感染性结膜充血的治疗
细菌感染引发：如果是细菌感染造成的结膜充血，常用的抗生素眼药水有左氧氟沙星滴眼液，它能有效抑制细菌生长，减轻炎症反应从而缓解结膜充血。一般来说，使用这类眼药水时，每天可使用3 - 4次，每次1 - 2滴。病毒感染引发：当是病毒感染引起结膜充血时，阿昔洛韦滴眼液是常用药物，它可以阻止病毒DNA的合成，达到抗病毒的作用，进而改善结膜充血状况，通常每天使用5次左右。
非感染性结膜充血的治疗
过敏导致：因过敏出现结膜充血时，色甘酸钠滴眼液较为常用，它能稳定肥大细胞，阻止过敏介质释放，减轻结膜的过敏反应，缓解充血症状。使用时一般每天滴用3 - 4次。
日常护理辅助治疗
休息与用眼：出现结膜充血时，要保证充足的休息，让眼睛得到充分放松。每天保证7 - 8小时的睡眠时间，避免长时间用眼，如连续看手机、电脑超过1小时就应该休息10 - 15分钟，减少眼睛的疲劳，有助于结膜充血的恢复。避免刺激：要避免眼部受到刺激，比如不要用手揉眼睛，因为手上可能携带细菌等病原体，会加重感染或刺激充血情况；同时要避免接触过敏原，若是过敏引起的结膜充血，还要注意远离花粉、尘螨等常见过敏原。
特殊人群注意事项
儿童患者：儿童出现结膜充血时，用药要格外谨慎。比如儿童使用抗生素眼药水时，像氧氟沙星滴眼液，18岁以下儿童要在医生指导下使用，因为儿童的眼部组织较为娇嫩，药物使用不当可能会对眼部发育产生影响。老年患者：老年人出现结膜充血时，要关注是否有其他基础疾病。如果老年人同时有高血压、糖尿病等疾病，在使用眼药水时要考虑药物与其他疾病用药的相互作用，最好在医生的综合评估下进行治疗，确保用药安全。