间质性膀胱炎目前并没有绝对“最好”的单一方法，通常需要综合治疗。一般来说，药物治疗是重要手段之一，比如使用肝素钠膀胱灌注可能有一定效果，但具体方案需根据患者情况制定。
药物治疗方面
口服药物：像阿米替林这类药物可能对间质性膀胱炎有一定作用，它属于抗抑郁药，能通过调节神经等起到缓解症状的效果，但具体使用需在医生评估后应用。膀胱灌注药物：除了肝素钠，还有透明质酸膀胱灌注也可考虑，透明质酸能在膀胱黏膜形成保护屏障，减轻炎症刺激。
非药物治疗途径
膀胱扩张：可以定期进行膀胱扩张，一般每周可能需要进行1 - 2次，通过膀胱扩张能暂时缓解膀胱痉挛等引起的疼痛等症状，但这只是短期缓解办法。生活方式调整：患者要注意避免食用辛辣、酸性等刺激性食物，比如辣椒、柑橘类水果等，同时要保持充足的水分摄入，每天建议饮水1500 - 2000毫升左右，以增加排尿次数，起到对膀胱的冲刷作用，减轻炎症刺激。
物理治疗辅助
体外冲击波治疗：部分患者可以尝试体外冲击波治疗，它通过特定的冲击波作用于盆腔区域，改善局部血液循环，缓解间质性膀胱炎相关的疼痛等症状，但治疗效果个体差异较大，一般可能需要进行多个疗程的治疗。生物反馈治疗：生物反馈治疗可以帮助患者学会控制盆底肌肉，通过仪器反馈让患者了解盆底肌肉的状态并进行调整，从而缓解间质性膀胱炎引起的盆底肌肉紧张等问题，通常需要在专业人员指导下进行多次治疗。