生殖器疱疹主要通过抗病毒药物来治疗，常用的有阿昔洛韦等，一般发作时及时用药能在一定程度上缓解症状、缩短病程，比如口服阿昔洛韦片，通常需要连续用药几天。
抗病毒药物治疗
阿昔洛韦： 属于核苷类抗病毒药物，能干扰病毒DNA合成，从而抑制病毒复制。可口服，也能外用软膏，口服一般用于病情较重或频繁复发的情况。伐昔洛韦： 是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，服用后在体内转化为阿昔洛韦发挥作用，疗效较好，服用相对方便。
局部护理措施
保持清洁干燥： 要注意患处的清洁，每天用清水轻轻清洗生殖器部位，但要避免用力搓洗。保持局部干燥，可穿宽松、透气的内裤，减少局部摩擦和潮湿环境，降低继发感染的风险。避免刺激： 患病期间不要搔抓患处，防止水疱破裂后引起感染扩散。同时，要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物可能会加重局部不适。
预防复发注意事项
增强免疫力： 日常生活中要注意劳逸结合，保证充足的睡眠，一般成年人每天建议保证7~8小时的睡眠时间。适当进行体育锻炼，如散步、慢跑等，每周可进行3~5次，每次30分钟左右，有助于提高身体免疫力，降低复发几率。避免高危行为： 生殖器疱疹主要通过性接触传播，所以要避免不洁性行为，固定性伴侣能有效降低感染风险。如果性伴侣患有生殖器疱疹，在发作期要避免性生活，治愈后也要做好防护措施。