孕酮正常还流褐色分泌物可能是以下情况导致的：一是先兆流产，二是生化妊娠，三是宫外孕。建议及时去医院检查以明确病因并对症治疗。
一、如果是先兆流产，这通常是由于胚胎在早孕期还未形成胎盘，处于尚不稳定的状态，各种因素都可能引发胎膜下出血，进而表现为阴道流血，也可能同时伴有下腹痛的症状。对于这种情况，一般建议及时前往医院进行保胎处理。具体来说，先兆流产的发生可能与胚胎自身因素、母体因素、环境因素等有关。比如胚胎染色体异常可能导致其发育不良从而引发流产；母体患有全身性疾病如严重感染、高热、严重贫血等，或存在内分泌异常、生殖器异常、免疫功能异常等，以及接触过多的放射线、甲醛等有毒有害物质，都可能增加先兆流产的风险。
二、如果是生化妊娠，通常是因为胚胎着床失败而导致的自然流产，在彩超下看不到孕囊，且人绒毛膜促性腺激素（HCG）不升或者下降，下降到正常后就会来月经。生化妊娠的发生可能与胚胎质量、子宫内膜容受性、母体激素水平等多种因素有关。
三、如果是宫外孕导致的，通常会以少量阴道流血为表现，同时还伴有剧烈腹痛。这种情况一般建议在医生指导下进行手术治疗。宫外孕的发生主要与输卵管炎症、输卵管手术史、输卵管发育不良或功能异常、辅助生殖技术、避孕失败等因素有关。
总之，当孕酮正常但出现流褐色分泌物时，要及时就医，通过相关检查明确具体原因，并根据不同情况采取相应的治疗措施。