治疗头皮糠疹常用的药物有酮康唑洗剂、二硫化硒洗剂等。一般来说，酮康唑洗剂对于头皮糠疹有较好的疗效，通常每周使用2-3次。
外用抗真菌药物
酮康唑洗剂：它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌作用，可有效减轻头皮糠疹引起的头皮瘙痒、脱屑等症状。使用时取适量本品涂于湿润的头皮上，轻轻按摩至产生泡沫，保留3-5分钟后用清水冲洗干净。二硫化硒洗剂：能减少表皮细胞的更替，抑制皮脂中脂肪酸的过氧化，从而缓解头皮糠疹症状。使用方法是先将头发用温水浸湿，取5-10毫升本品涂抹在头皮上，按摩3-5分钟后冲洗干净，每周使用2次左右。
口服药物情况
维生素B族：当头皮糠疹与维生素B族缺乏有关时，可适当补充维生素B族。比如维生素B2、维生素B6等，它们有助于维持皮肤的正常代谢。一般来说，成人每天维生素B2的摄入量约为1.2-1.5毫克，维生素B6约为1.4-2毫克，但具体用量需遵医嘱。抗组胺药物：如果头皮糠疹伴有明显瘙痒，影响生活质量，可在医生指导下使用抗组胺药物。像氯雷他定，它能缓解过敏反应引起的瘙痒等症状，成人一般每天服用1次，每次10毫克。但要注意，服用后可能会有嗜睡等不良反应，驾驶车辆或操作机械者需慎用。
注意事项及特殊人群
对于儿童头皮糠疹患者，使用上述药物时要格外谨慎。儿童使用酮康唑洗剂等外用药物时，应在成人监护下使用，且要注意避免药物进入眼睛。而对于孕妇和哺乳期女性，使用任何药物都需要咨询医生，因为药物可能会通过各种途径影响胎儿或婴儿。同时，在使用药物治疗头皮糠疹期间，要注意保持头皮清洁，避免过度搔抓头皮，以免加重皮损。饮食上也要注意，少吃辛辣、油腻、刺激性食物，多吃新鲜的蔬菜和水果，保持良好的生活作息，这有助于头皮糠疹的恢复。