肛周脓肿手术后流黄水是正常现象，主要有两种情况：一是脓肿术后的分泌物，二是手术导致肛门括约肌松弛而有部分肠液流出从而表现为流黄水。术后可通过如下方式进行处理：
一、药物治疗：
1.手术后若脓液排出，症状可暂时缓解进而溃疡愈合。但要是脓液排出不畅或持续积聚，感染继续扩散，症状会再度出现，还可能形成新的脓肿及多个溃疡。术后可用康复新液治疗，其主要作用是促进伤口愈合，同时能减轻炎症、缓解疼痛、促进细胞增殖和新肉芽组织生长。
2.也可以口服抗生素，如头孢呋辛酯、左氧氟沙星、甲硝唑片等。如果患者有局部伤口，还可通过用外部纱布浸泡药液来减少局部组织细菌的增殖，促进肉芽组织生长，促进新皮肤生成，减轻患者局部疼痛，或者使用1：5000高锰酸钾溶液进行坐浴。
二、术后护理：
1.术后要注意内出血的发生，因为伤口容易因结扎线脱落等原因而出血，所以咳嗽或打喷嚏时要小心避免过度用力。
2.要防止伤口被挤压，尽量以俯卧姿势睡觉。
3.肛周脓肿患者应吃清淡易消化食物，避免辛辣刺激性食物，若饮食不当导致大便干燥，排出干硬粪便时会撕裂肛门皮瓣、划伤肛门皮肤和黏膜，引起感染形成脓肿。日常生活中要注意摄入富含纤维的食物，如红薯、茄子、香蕉等，同时要调整饮食、多饮水，避免大便干燥，以利于病情恢复。
总之，肛周脓肿手术后流黄水通常是正常的术后表现，可通过药物治疗和良好的术后护理来促进恢复。