孕妇怀孕三个月阴道流血可能由以下原因引起：
1.先兆流产：如果孕妇的宫颈口松弛、胚胎发育不良、孕激素水平低等，可能会导致先兆流产，出现阴道流血。此时，孕妇可能还会伴有腹痛、腰痛等症状。如果出血量较多，可能会导致难免流产。
2.前置胎盘：前置胎盘是指胎盘附着在子宫下段或覆盖在子宫颈内口处，在妊娠晚期或分娩时，前置胎盘可能会导致无痛性阴道流血。
3.胎盘早剥：胎盘早剥是指妊娠20周后或分娩期，正常位置的胎盘在胎儿娩出前，部分或全部从子宫壁剥离。胎盘早剥可能会导致孕妇突然出现持续性腹痛，伴有或不伴有阴道流血。
4.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜增生形成的赘生物，质地脆弱，容易出血。孕妇可能会出现性生活后阴道流血，也可能会在妇科检查时发现。
5.其他原因：孕妇患有阴道炎、宫颈炎、宫颈癌等，也可能会导致阴道流血。
如果孕妇出现阴道流血，应立即就医，进行详细的检查，如超声检查、血常规、凝血功能等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇应卧床休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情放松。