龟头起小水泡的原因有很多，可能是感染、过敏、生殖器疱疹等。以下是一些可能的原因：
1.感染：龟头炎、生殖器疱疹、梅毒等都可能导致龟头起小水泡。龟头炎可由细菌、真菌、滴虫等感染引起，表现为龟头红肿、疼痛、起小水泡等。生殖器疱疹是由单纯疱疹病毒感染引起的，主要通过性接触传播，表现为龟头、冠状沟等部位出现水疱、溃疡等。梅毒是由梅毒螺旋体感染引起的，可侵犯全身各器官，早期表现为硬下疳，即在生殖器部位出现无痛性溃疡，随后可出现梅毒疹，即在全身皮肤、黏膜出现红色或红褐色的丘疹、水疱等。
2.过敏：使用某些药物、避孕套、清洁剂等可能导致龟头过敏，引起局部红肿、起小水泡等症状。
3.生殖器部位的其他病变：如尖锐湿疣、阴茎癌等也可能导致龟头起小水泡。
4.全身性疾病：某些全身性疾病，如糖尿病、艾滋病等也可能导致龟头起小水泡。
需要注意的是，龟头起小水泡可能是一种症状，也可能是多种疾病的表现。如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，以明确病因，并采取相应的治疗措施。同时，要注意保持龟头清洁卫生，避免搔抓、摩擦等刺激，避免不洁性生活。