早上起床拉稀可能由多种原因引起。比如，肠道菌群失调可能导致这种情况，有些人肠道内有益菌减少，有害菌增多，就容易在早上出现拉稀现象。一般来说，这种情况可能持续数天到数周不等。
饮食因素导致
进食生冷食物： 如果前一天晚上吃了过多生冷的食物，像冰镇饮料、冰淇淋等，这些生冷刺激会影响肠道功能，导致早上起床后拉稀。比如，有些人大量饮用冰镇啤酒后，很可能出现早上拉稀的情况。食物过敏或不耐受： 比如对乳糖不耐受的人，早上喝了牛奶后，就可能出现拉稀症状。因为体内缺乏分解乳糖的酶，无法消化牛奶中的乳糖，从而引起肠道不适和拉稀。
腹部着凉引起
夜间腹部保暖不当： 夜间睡眠时如果没有盖好被子，腹部着凉，肠道受到寒冷刺激，蠕动加快，就会导致早上起床拉稀。尤其是在季节更替时，气温变化较大，更易出现这种情况。比如春秋季晚上，有些人只盖一层薄被，就可能因为腹部着凉而早上拉稀。
肠道疾病影响
肠易激综合征： 这是一种常见的功能性肠道疾病，患者的肠道比较敏感，容易受多种因素影响。早上起床时，可能因为肠道的应激反应出现拉稀症状，还可能伴有腹痛、腹胀等表现，这种情况可能会反复出现，持续时间可能较长，有的患者会持续数月甚至更久。肠炎： 如细菌性肠炎，由于细菌感染肠道，炎症刺激肠道黏膜，导致肠道分泌增多、蠕动加快，从而引起早上拉稀。如果是病毒感染引起的肠炎，也可能出现类似症状，而且可能具有一定传染性，需要注意隔离。