每天早上肚子疼拉稀，拉完就不疼，可能是以下原因：
1.五更泻：又名鸡鸣泻，是中医的一个病证名，主要表现为每在黎明前（五更时分）脐腹作痛，肠鸣即泻，泻后则安，大便稀薄，夹有不消化之物，形寒肢冷，腰膝酸软。常因肾阳虚衰、命门之火不足所致。常用的药物有四神丸、附子理中丸等。
2.肠易激综合征：是一组持续或间歇发作，以腹痛、腹胀、排便习惯和（或）大便性状改变为临床表现，而缺乏胃肠道结构和生化异常的肠道功能紊乱性疾病。精神、饮食等因素常诱使症状复发或加重。常用的药物有匹维溴铵、洛哌丁胺等。
3.炎症性肠病：包括溃疡性结肠炎和克罗恩病，病变主要累及回肠末段和邻近结肠，也可累及全结肠和末段回肠，常表现为腹泻、黏液脓血便、腹痛等症状。这类疾病的诊断需要结合临床表现、内镜检查、病理检查等综合判断。治疗主要包括氨基水杨酸制剂、糖皮质激素、免疫抑制剂等。