新生儿眼睛肿可能是以下原因导致：
一、生理因素：新生儿身体较为虚弱，需大量睡眠。若睡眠不足且有哭闹情况，眼部组织易充血水肿。对此，家长要给新生儿足够安全感，保证其睡眠时间，通常症状可缓解。
二、过敏性皮炎：新生儿皮肤敏感，眼部皮肤遭蚊虫叮咬后，可能影响体液代谢及血液循环，进而出现局部红肿、疼痛。此时家长应遵医嘱给新生儿涂抹莫匹罗星软膏、炉甘石洗剂等药物。平时需留意新生儿周围有无蚊虫。
三、细菌性结膜炎：新生儿常有用手揉眼习惯，若手部有细菌，可能引发细菌性结膜炎，常有白眼球发红、眼痒、眼睑红肿等症状。家长可在医生指导下用生理盐水给新生儿冲洗，注意新生儿卫生，避免其用手揉眼。
除上述原因外，还有如泪囊炎等其他可能性疾病，需及时诊断并对症治疗。总之，当发现新生儿眼睛肿时，要根据具体情况采取相应措施，必要时应及时就医。