泌尿系结核经过规范治疗有很大可能治彻底，但治疗周期较长，一般需6 - 9个月甚至更长时间。
早期泌尿系结核
早期发现的泌尿系结核，若能及时采用抗结核药物等规范治疗，病变较轻时通过药物控制结核菌繁殖，有较大几率彻底治愈，此阶段及时干预效果较好，需密切遵循医嘱用药。
病变较轻的泌尿系结核
当泌尿系结核病变较轻时，比如肾脏结核病灶局限，通过合理的抗结核治疗，可有效杀灭结核杆菌，阻止病情进一步发展，实现彻底治愈，治疗中要严格按疗程用药保证疗效。
病变较严重但未累及重要脏器的泌尿系结核
若泌尿系结核病变较严重，但尚未累及肾脏等重要脏器的关键结构，经过正规的抗结核治疗联合必要时的手术干预（如病灶清除等），也有很大希望达到彻底治愈，手术前后都要配合抗结核药物治疗。
特殊人群的泌尿系结核
对于儿童泌尿系结核患者，要格外注意，由于儿童处于生长发育阶段，治疗时要选择对其生长影响小的抗结核药物，且需密切监测药物不良反应和生长指标，保证在治愈泌尿系结核的同时不影响儿童正常生长；老年泌尿系结核患者，往往合并其他基础疾病，治疗时要综合考虑基础疾病情况，调整抗结核治疗方案，确保治疗安全有效，同时关注老年患者的营养状况等，以提高治疗效果。