非淋菌性尿道炎是由沙眼衣原体、解脲支原体等病原体引起的性传播疾病，男性患者常见症状有尿道刺痒、灼痛，还可能出现尿频、尿急，晨起时尿道口有少量黏液性分泌物，有时仅表现为痂膜封口或内裤污秽。女性患者症状相对不典型，约50%的人有尿频、尿急等尿道刺激症状，部分人会有阴道分泌物增多、外阴瘙痒等表现。
症状表现差异
男性非淋菌性尿道炎： 尿道不适感较为明显，除了上述的刺痒、灼痛、分泌物等情况，有的患者尿道分泌物呈浆液性，较稀薄，量也相对较少。部分患者可能在长时间不排尿或晨起时，尿道外口会有少量稀薄的黏液性分泌物，有时仅表现为裤裆污秽。女性非淋菌性尿道炎： 尿道症状往往不如男性典型，很多女性可能没有明显的尿道不适，而是以宫颈炎症为主要表现，如宫颈充血、水肿、糜烂，有黏液脓性分泌物等。同时，阴道可能会有分泌物增多的情况，外阴可能出现瘙痒等不适。
症状出现时间
非淋菌性尿道炎的潜伏期一般为1~3周。感染后，在潜伏期内可能没有明显症状，但过了潜伏期后，就会逐渐出现上述的尿道或生殖系统相关症状。比如感染沙眼衣原体后，通常在1~3周左右开始出现症状。
伴随症状情况
部分患者可能会伴有附睾炎，男性表现为附睾肿大、疼痛、触痛，严重时可能影响生育功能。女性患者如果病情蔓延，可能会引起盆腔炎等，出现下腹部疼痛、发热等症状，但相对男性来说，女性出现严重并发症的情况在非淋菌性尿道炎患者中比例相对较低，但也需要重视。