眼睛不自主流泪的病因包括外界刺激、泪液排出不畅以及其他眼部疾病。
一、外界刺激：
当眼部受到洋葱、辣椒等气味刺激，或者遭遇强风、冷空气等情况时，就会出现不同程度的流泪现象。这属于正常的生理反应，一般无需特殊治疗。但如果症状特别严重，已经对正常生活造成较大影响，那么患者可以通过一些措施来进行眼部防护，比如在大风天气时减少外出，若要外出则佩戴防风眼镜，并且尽量远离刺激性气味等。
二、泪液排出不畅：
如果处于室内且没有任何刺激的环境下，仍然频繁泪流不止，那就有可能是泪道阻塞导致泪液排出受阻。此时应完善泪道相关检查，如进行泪道冲洗、泪道探通等，有必要的话还可进行泪道造影，以明确病变发生的具体位置，然后给予相应的手术治疗，例如泪小点切开术、泪囊鼻腔吻合术等。
三、其他眼部疾病：
当患有结膜炎、角膜炎、过敏等其他眼部疾病时，可能会伴有流泪这种刺激性症状。在完善检查确定诊断后，应积极治疗原发病，这样流泪的症状也会相应得到缓解。
总之，眼睛不自主流泪可能由多种原因引起，需要根据具体情况进行诊断和治疗，以改善眼部不适症状。