宝宝指甲盖分层脱落，主要可能与以下因素有关：一是营养物质缺乏，二是真菌感染，三是手足口病。
一、营养物质缺乏：宝宝处于快速生长发育阶段，对各类营养物质的需求较大。若宝宝存在偏食、挑食的情况，长此以往，机体内可能就会出现营养物质的短缺。特别是当钙、铁、锌等微量元素缺乏时，会影响指甲的营养供给，进而导致指甲出现分层脱落现象。比如，钙对指甲的硬度和强度有重要作用，缺乏时可能使指甲变得脆弱易分层；铁参与血红蛋白的形成，缺铁可能影响指甲的正常生长；锌在蛋白质合成等方面发挥关键作用，缺锌也可能导致指甲出现问题。
二、真菌感染：当指甲遭受真菌感染后，宝宝的指甲会增厚，甲板表面会呈现出凹凸不平的状态，而且指甲极易断裂。这种真菌感染通常从一个指甲开始，然后逐渐向其他指甲蔓延。
三、手足口病：若宝宝在半年内曾患过手足口病，由于病毒会侵犯甲床，影响到指甲的营养供应，就可能造成指甲暂时性地出现分层脱落现象。不过，指甲脱落后还会有新的指甲生长出来，在临床上一般无需特别处理。
总之，宝宝指甲盖分层脱落可能是多种原因引起的，需要根据具体情况进行分析和处理。