结膜炎可分为细菌性结膜炎、病毒性结膜炎、过敏性结膜炎等，要依据不同感染源选取不同治疗方式。
一、细菌性结膜炎通常需考虑使用抗生素，在排除自身过敏的情况下，可用如妥布霉素滴眼液、左氧氟沙星滴眼液等。妥布霉素滴眼液对多数革兰阴性杆菌及阳性球菌等有良好抗菌作用，可用于治疗由这些病菌引起的眼部感染。左氧氟沙星滴眼液则对包括葡萄球菌属、链球菌属等在内的多种细菌具有较强抗菌活性，适用于多种细菌性结膜炎。
二、病毒性结膜炎要配合抗病毒的滴眼液进行治疗，比如阿昔洛韦滴眼液或更昔洛韦滴眼液等。对于较为严重的情况，还需配合使用类固醇类激素药物来减轻症状。阿昔洛韦滴眼液能有效抑制病毒的复制，对多种疱疹病毒有抑制作用。更昔洛韦滴眼液对巨细胞病毒等也有较好的抑制效果。
三、过敏性结膜炎的首要治疗方式是先脱离过敏源，然后建议使用皮质类固醇激素类药物缓解眼部不适症状，同时加上口服抗过敏药物，如氯雷他定等进行治疗。氯雷他定可缓解过敏引起的各种症状，帮助减轻过敏性结膜炎患者的不适。
患有结膜炎一定要及时就诊，先查明病因，找到病因后对症予以治疗，以免延误病情。
总之，对于结膜炎的治疗，要明确其类型，针对性地选择合适的药物和方法，同时注意及时就医和正确处理。