最里面大牙旁边肉肿了咽口水都痛，可能是由牙周脓肿、牙龈溃疡或者智齿冠周炎等疾病导致。在治疗上需依据病因进行处理。
一、牙周脓肿：如果患者患有牙周病，且最里面大牙的牙周袋较深，病情严重时牙周袋内会有大量牙石和软垢，这就容易引发牙周脓肿。当脓肿蔓延或扩散，就可能致使咽喉疼痛，从而出现咽水痛症状。在治疗时，可在医生指导下使用阿莫西林或甲硝唑等抗生素进行抗炎治疗。比如阿莫西林，它是一种广谱抗生素，能有效抑制多种细菌的生长和繁殖，从而减轻炎症反应；而甲硝唑则对厌氧菌有较好的抑制作用，可针对性地应对牙周脓肿中的厌氧菌感染。
二、牙龈溃疡：当患者患有该疾病且溃疡较为严重时，局部疼痛会很明显，口腔内唾液不断刺激溃疡，就可能出现咽口水疼痛现象。治疗上，可在医生指导下使用曲安奈德口腔软膏进行局部涂抹。这种软膏可以起到抗炎、减轻水肿和缓解疼痛的作用，有助于促进溃疡的愈合。
三、智齿冠周炎：患者患有此疾病时，最里面大牙周围的牙龈软组织会发炎，出现局部疼痛及红肿等不适症状，当炎症累及到咽喉部软组织时，就会引发咽口水痛。治疗方面，可在医生指导下使用甲硝唑或头孢克洛等抗生素来消炎。其中，甲硝唑可有效杀灭相关的厌氧菌，头孢克洛则能广泛地抑制多种细菌，它们能帮助缓解智齿冠周炎及其引发的一系列症状。
总之，当最里面大牙旁边肉肿且咽口水痛时，要及时就医明确具体病因，并根据病因采取针对性的治疗措施。