乳头内陷主要是由多种原因引起的，其中先天性因素较为常见，据统计，约有2%～5%的女性存在不同程度的乳头内陷。
先天性发育异常导致
乳腺导管短缩： 在胚胎发育过程中，乳腺导管如果发育异常，出现短缩情况，就会牵拉乳头，导致乳头内陷。这种情况从出生时可能就有一定迹象，而且一般双侧乳房可能都会受到影响，只是程度可能不同。乳头平滑肌发育不良： 乳头部位的平滑肌发育不良也是先天性乳头内陷的一个原因。乳头里面有平滑肌纤维，若发育不好，就无法正常牵拉乳头使其突出，从而出现内陷状况。
疾病因素引发
乳腺疾病： 某些乳腺疾病也可能导致乳头内陷，比如乳腺肿瘤。当乳房内的肿瘤生长到一定程度，侵犯乳腺导管、韧带等组织时，就会引起乳头内陷。像乳腺癌，肿瘤细胞侵犯乳腺导管，会使导管缩短，进而牵拉乳头内陷，这种情况往往单侧发病，且可能还伴有乳房肿块、乳房皮肤橘皮样改变等症状。炎症感染： 乳房部位的炎症感染也可能导致乳头内陷。例如乳腺炎，炎症刺激会引起乳腺组织的粘连、挛缩，从而影响乳头的正常位置，导致乳头内陷，一般会伴有乳房红肿、疼痛、发热等炎症表现。
穿着因素影响
内衣不合适： 长期穿着过紧的内衣，尤其是过小的胸罩，会对乳头造成压迫，影响乳头的正常发育，时间长了就可能导致乳头内陷。比如青春期女性如果过早穿戴过小过紧的胸罩，就容易出现这种情况。而且这种情况可能双侧发生，调整合适的内衣后，部分轻度内陷可能会有所改善，但如果已经形成较严重内陷，仅靠调整内衣可能效果不佳。束胸： 一些特殊人群，比如年轻女性为了追求身材，长期束胸，会严重影响乳房的正常发育，包括乳头的发育，导致乳头内陷。束胸会使胸部受到束缚，血液循环不畅，也会影响乳腺导管等组织的正常生长，进而引发乳头内陷问题。