龟头炎的治疗药物需根据病因来选择，一般细菌感染引起的龟头炎可选用抗生素类药物，如莫匹罗星软膏等，通常局部用药即可，一般用药后数天内症状会有改善。
细菌感染性龟头炎用药
抗生素类外用药：如果是细菌感染导致的龟头炎，常用莫匹罗星软膏，它能抑制细菌生长，起到抗感染作用。这类药物局部涂抹，一般每天涂抹2 - 3次，用药后要保持局部清洁干燥。真菌性龟头炎用药：若是真菌感染引起的龟头炎，可使用抗真菌药物，像克霉唑乳膏。它能抑制真菌细胞膜的合成，从而发挥抗真菌功效。使用时同样是局部涂抹，一天使用1 - 2次。
滴虫性龟头炎用药
硝基咪唑类药物：滴虫感染引发的龟头炎，可选用甲硝唑。它能干扰滴虫的DNA合成，起到杀灭滴虫的作用。一般可以口服甲硝唑片，但要注意孕妇及哺乳期妇女需谨慎使用，必须在医生指导下用药。
过敏性龟头炎用药
糖皮质激素类药物：对于过敏性龟头炎，可短期使用糖皮质激素类外用药，如氢化可的松乳膏。它能减轻过敏引起的炎症反应，缓解红肿、瘙痒等症状。不过这类药物不能长期大面积使用，以免引起不良反应。同时，要尽量避免接触过敏原，比如某些特殊材质的内裤等。需要注意的是，在使用药物治疗龟头炎时，首先要保持局部清洁卫生，每天用清水清洗龟头，避免刺激。如果症状持续不缓解或者反复发作，要及时就医，重新评估病因并调整治疗方案。而且不同病因导致的龟头炎用药差异较大，一定要在明确诊断后，在医生的指导下合理用药，不要自行随意用药，以免延误病情或导致不良反应。