男生小便的时候尿道刺痛，可能是以下原因引起：
1.尿道炎：尿道炎是尿道黏膜的炎症，多由细菌感染引起。除了尿道刺痛，还可能伴有尿频、尿急、尿道口红肿等症状。治疗尿道炎通常采用抗生素，如左氧氟沙星、阿莫西林等。同时，患者应注意多饮水，促进排尿，有助于病情恢复。
2.前列腺炎：前列腺炎是男性常见的疾病，可导致尿道刺痛、尿频、尿急、尿痛等症状。此外，还可能伴有会阴部、腰骶部疼痛等。治疗前列腺炎的方法包括药物治疗（如前列康、前列舒通等）、物理治疗（如微波、射频等）和生活方式调整（如避免久坐、规律性生活等）。
3.泌尿系统结石：泌尿系统结石如肾结石、输尿管结石等，也可能引起尿道刺痛。疼痛通常较为剧烈，还可能伴有血尿、恶心、呕吐等症状。治疗结石的方法根据结石的大小、位置等因素而定，较小的结石可以通过多饮水、运动等方式排出，较大的结石可能需要体外冲击波碎石或手术治疗。
4.其他原因：尿道损伤、尿道狭窄、性病等也可能导致尿道刺痛。
如果出现尿道刺痛，建议及时就医，进行相关检查，如尿常规、尿培养、超声等，以明确病因，并采取相应的治疗措施。此外，在治疗期间，应注意个人卫生，保持尿道口清洁，避免憋尿、久坐等。同时，应注意饮食清淡，避免辛辣刺激性食物，多喝水，有助于病情恢复。