通常情况下，科学地进行肠镜检查并不会产生什么危害。不过肠镜检查也可能会带来一些不良影响，主要包括麻醉副作用、肠道菌群失调、黏膜损伤等。
一、麻醉副作用：在做肠镜时往往需要注射麻醉剂，部分患者在注射麻药后，有可能出现诸如短暂性头痛、药物过敏、血压降低等情况。
二、肠道菌群失调：在做肠镜之前，需要服用泻药来清理肠道，而清理肠道之后，可能会引发体内电解质紊乱，进而导致肠道菌群失调。
三、黏膜损伤：在肠镜检查的过程中，由于操作方面的问题，可能会对肠道黏膜造成一定程度的损伤。
在进行肠镜检查前，专业医生会全面地进行评估，做无痛肠镜前会做好麻醉评估，以排除一些不必要的损伤。对于肠镜所带来的这些危害，一般来说是可以进行控制的，所以不必对做肠镜过于恐慌。
总之，要正确认识肠镜检查可能存在的影响，医生会做好相应评估和处理，不用过分担心。