长骨刺通常没有能完全消除骨刺的特效药物，但可以通过一些药物来缓解疼痛等症状。一般来说，非甾体抗炎药常被用于缓解长骨刺引起的疼痛，比如布洛芬等，不过具体用药需根据个体情况。
缓解疼痛的药物
非甾体抗炎药：像布洛芬缓释胶囊，它能抑制环氧化酶的活性，减少前列腺素合成，从而发挥抗炎、镇痛作用，可缓解长骨刺导致的局部疼痛不适，但可能会有胃肠道不适等副作用，比如少数人服药后可能出现恶心、呕吐等。萘普生片也是常用的非甾体抗炎药，同样通过抑制前列腺素合成来止痛，对缓解长骨刺引发的疼痛有一定效果，不过也可能引起头晕等不良反应。
营养软骨的药物
氨基葡萄糖：它可以参与软骨基质中蛋白多糖及胶原纤维的合成，刺激软骨细胞产生有正常多聚体结构的糖蛋白，改善关节软骨代谢，延缓骨关节疼痛的病理过程和疾病的进展，对长骨刺相关的关节问题有一定的辅助改善作用。一般需要连续服用一段时间才能看到较好效果。硫酸软骨素也有一定营养软骨的作用，能帮助维持软骨的弹性和功能，可能对长骨刺引起的关节病变起到一定的保护作用。
局部外用药物
双氯芬酸二乙胺乳胶剂：这是一种外用的非甾体抗炎药，可透过皮肤渗入局部炎症部位，达到抗炎、镇痛的效果。直接涂抹在长骨刺疼痛的部位，能缓解局部的疼痛不适，而且相比口服药，全身副作用相对较少，但个别人可能会出现局部皮肤过敏等反应，如涂抹部位发红、瘙痒等。辣椒碱软膏：外用后可以刺激神经末梢的P物质释放，消耗神经末梢的P物质，从而产生镇痛作用，对长骨刺导致的疼痛有一定的缓解作用，不过使用后可能会有局部的灼热感等。