医生通常不会直接为患者取扁桃体结石，主要有两方面原因：一是要先治疗慢性扁桃体炎以避免结石反复生长，因为取扁桃体结石只是治标不治本；二是取扁桃体结石本身可能会损伤扁桃体，所以医生不会轻易操作，具体情况如下。
一、取扁桃体结石治标不治本，需先治疗慢性扁桃体炎。
1.扁桃体结石是扁桃体病变的症状之一，与扁桃体存在慢性炎症刺激关系密切。由于扁桃体有慢性炎症，会不断有分泌物在扁桃体隐窝部位聚集，其中的钙镁磷酸盐会结晶、聚合而形成扁桃体结石。
2.若仅取出扁桃体结石而不消除扁桃体炎症，新的结石仍会出现。所以需要针对慢性扁桃体炎进行治疗，可使用胎盘球蛋白、转移因子等药物，同时含漱复方氯己定溶液、复方硼砂溶液等，这有助于缓解症状并消除慢性扁桃体炎，从而根源性消除扁桃体结石。
二、取扁桃体结石可能会带来损伤。
1.取扁桃体结石需在局部麻醉后进行，操作后扁桃体表面可能会有一定创伤。
2.在存在慢性扁桃体炎的情况下进行取结石操作，会加重扁桃体炎症。
对于有扁桃体结石的患者，建议提高机体抵抗力和免疫力，经常用生理盐水漱口，不要急于取扁桃体结石。如果结石反复生长，可考虑进行扁桃体切除手术。
总之，医生对于扁桃体结石的处理是综合考虑多种因素的，患者应了解这些情况并遵循医生的建议进行合理治疗和应对。