男性感染支原体后，症状表现多样。部分男性可能没有明显症状，而有症状的男性，常见的如非淋菌性尿道炎，会出现尿道刺痒、灼热感，还可能有不同程度的尿频、尿急、尿痛，尿道口轻度红肿，分泌物稀薄，量少，为浆液性或脓性，晨起时可能有“糊口”现象。
泌尿生殖系统症状表现
尿道炎表现： 除了上述尿道刺痒、灼热等症状外，有些男性可能会感觉尿道内不适，排尿时尿道有轻微的刺痛感，尤其是在尿液浓缩时更明显。部分患者尿道口会有少量稀薄的分泌物，颜色可能较清。前列腺炎相关： 少数男性支原体感染可能累及前列腺，引发前列腺炎，出现会阴部坠胀、疼痛，下腹部隐痛等不适，还可能影响排尿，出现尿频、尿不尽等症状，但相对非淋菌性尿道炎的症状会更复杂一些。
其他可能伴随症状
全身不适： 部分男性感染支原体后，可能会出现全身乏力、疲惫的感觉，精神状态不如往常，对日常工作和生活有一定影响。有些患者还可能有低热现象，体温一般在37.5℃左右，很少超过38℃。性功能影响： 长期的支原体感染如果没有得到有效控制，可能会对男性性功能产生一定影响，比如出现性欲减退，勃起功能也可能受到一定程度的影响，导致性生活质量下降。不过这种情况相对较少见，多是在感染未及时治疗且病情较重时才会出现。
症状出现的时间特点
潜伏期： 男性支原体感染的潜伏期一般为1~3周，在潜伏期内可能没有明显的自觉症状，但此时具有传染性。过了潜伏期后，上述的泌尿生殖系统及其他相关症状可能会逐渐显现出来，如果有高危性行为等情况，之后出现相关可疑症状就要警惕支原体感染的可能。