结石的治疗费用因结石的部位、大小、治疗方式等因素而异。一般来说，体外冲击波碎石治疗肾结石的费用大概在1000~3000元左右；而输尿管镜取石术治疗输尿管结石，费用可能在1万~2万元不等；如果是腹腔镜下胆囊结石切除术，费用通常在1万~3万元左右。
结石的部位影响费用
肾结石的治疗费用
肾脏小结石：如果肾结石直径小于0.6厘米，通常可以采用保守治疗，费用相对较低，可能在1000元以内，主要是药物排石等费用。较大肾结石：当肾结石直径大于0.6厘米时，可能需要体外冲击波碎石等治疗，费用会增加，如前面所说体外冲击波碎石大概1000 - 3000元。若结石较大需手术治疗，费用会更高。
输尿管结石的治疗费用
较小输尿管结石：直径小于0.6厘米的输尿管结石，可尝试药物治疗，费用可能在几百元到1000元左右。较大输尿管结石：直径大于0.6厘米的输尿管结石，可能需要输尿管镜取石术等，费用一般在1万 - 2万元左右，具体还与医院等级等因素有关。
治疗方式影响费用
保守治疗费用
药物保守：如果结石较小，通过服用排石药物等保守治疗，药物费用相对不高，一个疗程的排石药物可能在几百元内，但需要定期复查等，整体费用较低。
手术治疗费用
开放手术：传统的开放手术治疗结石创伤大，恢复慢，费用相对较高，可能在2万 - 5万元左右，但现在这种手术应用较少。微创手术：像经皮肾镜取石术等微创手术，相对开放手术创伤小，恢复快，费用一般在1.5万 - 3万元左右；输尿管软镜取石术治疗肾结石等，费用大概在2万 - 4万元左右。
医院等级影响费用
基层医院
基层医院的结石治疗费用相对较低，比如体外冲击波碎石在基层医院可能费用在800 - 2000元左右，手术治疗的话，费用可能比三甲医院低10% - 20%左右。
三甲医院
三甲医院设备先进，专家资源丰富，治疗结石的费用相对较高。同样是输尿管镜取石术，在三甲医院可能费用在1.2万 - 2.5万元左右，比一些基层医院要高一些，但医疗技术更有保障。