肚脐眼里面隐隐作痛可能是以下原因引起：
1.脐炎：细菌感染、局部摩擦等可能导致脐炎，出现肚脐眼红肿、疼痛、渗液等症状。可以使用聚维酮碘溶液消毒，涂抹莫匹罗星软膏等抗生素软膏，如有必要，还需口服抗生素进行治疗。
2.脐尿管瘘：胚胎时期，脐尿管未完全闭锁，会导致脐尿管瘘，出现肚脐眼分泌物增多、有异味，还可能伴有尿频、尿急、尿痛等症状。需要进行手术治疗，切除瘘管。
3.肠痉挛：这是一种胃肠道疾病，可能由饮食不当、腹部受凉等引起，表现为脐周阵发性疼痛，可伴有呕吐、腹泻等症状。可以通过腹部按摩、热敷等方法缓解，也可以服用颠茄片、山莨菪碱等药物。
4.肠梗阻：肠道内容物不能正常运行或通过，会导致肠梗阻，出现脐周疼痛、呕吐、停止排气排便等症状。需要根据病情采取禁食、胃肠减压、补液、灌肠等治疗方法，严重者可能需要手术治疗。
5.其他：寄生虫感染、腹部肿瘤等也可能导致肚脐眼隐痛，需要进一步检查才能明确诊断。
如果肚脐眼疼痛持续不缓解或伴有其他症状，建议及时就医，明确病因，以便进行针对性治疗。同时，要保持肚脐眼清洁干燥，避免搔抓和刺激。