肺结节形成的原因有多种，其中感染因素较为常见，比如约有10%-20%的肺结节可能是由结核分枝杆菌感染引起的，结核杆菌感染肺部后会在局部形成结节样病变。另外，职业暴露也是一个因素，长期接触石棉、铍、镉等职业性粉尘的人群，患肺结节的风险会增加，据统计，长期接触这类粉尘的人群中，肺结节的发生率比普通人群高20%左右。还有一种情况是遗传因素，某些遗传性疾病可能会增加肺结节的发生几率，比如结节性硬化症患者，有一定概率会出现肺部的结节病变。
感染因素相关
结核分枝杆菌感染： 当人体感染结核分枝杆菌后，结核杆菌会在肺部引发免疫反应，形成结节状的病灶。这种感染导致的肺结节，在影像学上通常有一定的特征表现，需要通过进一步的检查来明确诊断。其他病原体感染： 除了结核分枝杆菌，一些病毒、真菌等病原体感染也可能引起肺结节。例如，某些特殊的病毒感染肺部后，也会刺激肺部组织形成结节，但相对来说，这类情况的发生率相对结核感染要低一些。
职业暴露方面
石棉接触： 石棉是一种常见的工业粉尘，长期吸入石棉纤维会对肺部造成损害，引发炎症反应，进而导致肺结节的形成。在一些石棉加工厂工作的工人，由于长期接触石棉，患肺结节的风险显著升高。铍等粉尘接触： 长期接触铍、镉等粉尘的职业人群，肺部受到这些粉尘的刺激，会逐渐出现结节样改变。这些粉尘会沉积在肺部，引起肺部组织的异常增生，形成肺结节。
遗传因素影响
结节性硬化症关联： 结节性硬化症是一种常染色体显性遗传性疾病，患者除了会有皮肤、神经系统等方面的表现外，肺部也可能出现结节病变。这种遗传因素导致的肺结节，往往具有家族聚集性，家族中有结节性硬化症患者的人群需要密切关注肺部情况。其他遗传性疾病： 虽然相对少见，但一些其他遗传性疾病也可能与肺结节的发生有关。比如某些先天性的基因缺陷疾病，可能会使肺部组织更容易出现结节样的异常改变，不过具体的发病机制还在进一步的研究当中。