内分泌紊乱的症状多样，比如女性可能会出现月经周期紊乱，有的女性月经提前或推迟超过7天以上较为常见。男性可能表现为性功能减退，约有10% - 15%的男性内分泌紊乱者会出现性欲下降等情况。
月经与生殖方面的症状
女性月经异常：除了月经周期改变，还可能出现月经量的变化，有的女性月经量增多，甚至可能超过80ml；有的则月经量减少，少于20ml。同时，内分泌紊乱还可能影响排卵，导致不孕不育，据统计，因内分泌紊乱导致不孕的女性占不孕总数的15% - 25%左右。男性生殖问题：除了性功能减退，还可能出现睾丸功能异常，例如睾丸素分泌减少，会使男性的第二性征变弱，像胡须生长变稀疏等情况。
皮肤方面的症状
痘痘与色斑：内分泌紊乱容易引发皮肤问题，很多人会出现痘痘反复长的情况，尤其是青少年和年轻女性更为常见。另外，色斑也是常见表现，比如黄褐斑，约有20% - 30%的女性在内分泌紊乱时会出现面部黄褐斑。
代谢与体重方面的症状
体重变化：内分泌紊乱可能导致体重异常，有的人体重会无故增加，比如甲状腺功能减退的患者，约有50% - 80%会出现体重增加的情况，每月可能增加1 - 2公斤；而有的人则会体重无故减轻，糖尿病患者如果血糖控制不佳，因内分泌紊乱影响代谢，可能会出现体重迅速减轻的情况。代谢异常表现：还可能出现血糖、血脂异常，比如血糖升高，空腹血糖可能超过6.1mmol/L，血脂中的甘油三酯、胆固醇等也可能出现异常升高的情况。
情绪与精神方面的症状
情绪波动：内分泌紊乱会影响神经递质的平衡，导致情绪容易波动，约有60% - 70%的女性在经期前后会因为内分泌变化出现情绪焦虑、抑郁等情况。同时，可能出现精神萎靡，对事物缺乏兴趣等表现，长期内分泌紊乱还可能增加患抑郁症的风险。