脊索瘤临床上治疗困难，预后差，局部复发率高。该疾病难以治愈，如果患者不治疗，后期寿命大概在半年到2年之间。不管采用何种治疗方案，脊索瘤局部复发率都较高且预后不良，即便采用手术联合放射治疗这一目前主张的方式，5年复发率仍高达70%。若不能完全切除再加上放射治疗，复发率会更高，甚至可达100%，且复发通常在术后2-3年内，是导致患者术后死亡的关键原因。
一、脊索瘤治疗困难：
1.临床上对于脊索瘤的治疗相对而言比较棘手，很难实现完全治愈。
二、脊索瘤预后差：
1.患者若不进行治疗，其诊断后期的存活时间较短，大约在半年至2年这个范围。
三、脊索瘤局部复发率高：
1.无论采用何种治疗手段，脊索瘤的局部复发情况都较为突出，预后情况不理想。
2.手术联合放射治疗这种主流方式，5年的复发率依然很高，可达到70%。
3.不能完全切除并配合放射治疗的话，复发率极高，能达到100%。
4.复发常常发生在术后的2-3年内，这成为术后患者死亡的重要因素。
总结概况提示：脊索瘤存在治疗难、预后差、复发率高的特点，这些因素严重影响患者的生存状况和治疗效果。