抗磷脂抗体综合征的治疗主要围绕抗凝等展开。一般来说，抗凝治疗是关键手段之一。
抗凝治疗为主
普通肝素： 可通过增强抗凝血酶Ⅲ的活性发挥抗凝作用，常用于抗磷脂抗体综合征的急性期治疗，需要在医生监测下使用，根据患者情况调整剂量。低分子肝素： 相比普通肝素，低分子肝素生物利用度高、半衰期长，皮下注射即可，使用相对方便，也是常用的抗凝药物，一般每日1 - 2次皮下注射。
免疫抑制治疗
糖皮质激素： 对于病情较重或有重要脏器受累的患者，常联合使用糖皮质激素。如泼尼松，起始剂量一般为每日0.5 - 1mg/kg，根据病情逐渐调整剂量，但长期使用需注意其可能带来的副作用，像骨质疏松、感染风险增加等。免疫抑制剂： 例如环磷酰胺，可用于病情较为顽固的患者。不过环磷酰胺有骨髓抑制等不良反应，使用过程中需要定期监测血常规等指标。
对症支持治疗
针对血栓形成的对症： 如果患者出现动脉或静脉血栓，除了抗凝等治疗外，还需根据血栓部位等情况进行相应处理。比如对于脑梗死等情况，可能需要进行改善脑循环等支持治疗，但主要基础还是抗凝等针对抗磷脂抗体综合征本身的治疗。针对其他表现的对症： 若患者有血小板减少等情况，必要时可能需要输注血小板等支持治疗，但这也是在整体治疗框架下进行，核心还是控制抗磷脂抗体相关的异常免疫反应来从根本上改善病情。