焦虑症引发的胃肠功能紊乱，需先依据焦虑症状况给予心理与药物治疗，再针对紊乱症状采用促进胃肠动力、益生菌类等药物进行医治。
焦虑症导致的胃肠功能紊乱属于胃肠神经官能症，是由情绪异常所引起，所以治疗时要先减轻焦虑情绪，再来调节胃肠功能。对于焦虑症，能选择心理治疗和药物治疗。在心理治疗方面，可通过精神分析疗法去发现自身内心的矛盾与需求，并寻求专业医生的帮助。药物治疗方面，可服用的药物包括劳拉西泮、奥沙西泮、地西泮、丁螺环酮等。
胃肠功能紊乱则可服用如西沙比利、多潘立酮等促进胃肠动力的药物，或者服用如乳酸菌素片、地衣芽孢杆菌活菌胶囊等益生菌类药物。日常生活里还需要调整饮食，尽可能食用容易消化的食物，避免油腻、生冷、刺激性食物，保持良好的饮食习惯，避免暴饮暴食，适当增加体育锻炼，以促进肠道吸收和消化。
总之，对于焦虑症引起的胃肠功能紊乱，要从焦虑症治疗和胃肠功能调节两方面着手，同时注意生活中的各方面调整，以促进康复。