婴儿长湿疹的原因较多，通常与遗传、皮肤屏障功能不完善以及环境因素等有关。比如约60%的婴儿湿疹患儿有家族过敏史。
遗传因素方面
家族过敏史影响： 如果父母一方有过敏性疾病，如哮喘、过敏性鼻炎等，婴儿患湿疹的概率会增加。有研究表明，父母双方都有过敏史时，婴儿湿疹发生率能达到40%以上。特定基因关联： 一些特定基因的突变也可能与婴儿湿疹的发生相关，比如与皮肤屏障功能、免疫调节相关的基因出现异常，会使婴儿更容易长湿疹。
皮肤屏障功能不完善方面
皮肤角质层薄： 婴儿的皮肤角质层比成人薄很多，厚度仅为成人的1/3左右，这使得外界的刺激更容易侵入皮肤，从而引发湿疹。皮肤保水能力差： 婴儿皮肤的皮脂腺发育还不完善，分泌的油脂少，导致皮肤保水能力弱，皮肤容易处于干燥状态，而干燥的皮肤更易发生湿疹，大约50%的婴儿湿疹与皮肤干燥有关。
环境因素方面
衣物材质刺激： 如果给婴儿穿的衣物材质不好，比如化纤材质，它会摩擦婴儿皮肤，容易引发湿疹。一般建议给婴儿选择纯棉材质的衣物。环境温度湿度影响： 环境温度过高或湿度过大也容易让婴儿长湿疹。当环境温度超过30℃，相对湿度高于60%时，婴儿皮肤更容易出现问题，有数据显示，在温度28~32℃、湿度60%~70%的环境中，婴儿湿疹发生率会比适宜环境高20%。接触过敏原： 婴儿接触到尘螨、花粉等过敏原时也可能长湿疹。比如室内尘螨数量超过1000只/克灰尘时，婴儿患湿疹的风险明显升高。