中医诊断和治疗疾病十分注重辨证论治，肛门湿疹的诊断与治疗亦是如此，通常可分为湿热下注、脾虚湿盛、血虚风燥这三个证型。
一、湿热下注型：治疗上主要侧重于清热利湿，可采用龙胆泻肝汤加减来调理。龙胆泻肝汤有清肝胆实火、泻下焦湿热的作用，能有效改善因湿热下注导致的肛门湿疹相关症状。
二、脾虚湿盛型：其治疗重点在于健脾利湿，可运用除湿胃苓汤进行调理。除湿胃苓汤能起到利水渗湿、健脾和胃的功效，对脾虚湿盛型肛门湿疹有较好疗效。
三、血虚风燥型：在治疗方面主要是滋阴养血、祛风润燥，可选用四物消风散加减来进行调理。或者也可选取一些清热解毒、去湿止痒的中药熬水后进行外敷或外洗以达到止痒目的，比如苦参、地肤子、艾叶、荆芥等。而若皮肤表面有破溃、有糜烂渗出的情况，则需要应用一些具有收敛、清热解毒作用的中药，如黄柏、野菊花、马齿苋等。
总之，中医对于肛门湿疹的治疗会根据不同证型采用相应的方法和药物，以实现对症治疗，改善患者症状。