尿路感染通常是由细菌等病原体入侵泌尿系统引起的。比如，大约有80%的尿路感染是由大肠埃希菌等肠道细菌上行感染所致。
病原体入侵途径
上行感染： 这是最常见的途径。细菌从尿道口进入，沿着尿道向上蔓延到膀胱、输尿管甚至肾脏。例如，女性的尿道短而直，长度约3 - 5厘米，相比男性更容易发生上行感染。性生活是导致女性上行感染的一个常见因素，因为性生活可能会将尿道口周围的细菌挤入尿道。血行感染： 细菌通过血液循环到达泌尿系统引起感染。这种情况相对较少见，通常是身体其他部位有严重感染灶，细菌随着血液传播到肾脏等泌尿系统部位。比如，皮肤感染、肺炎等疾病，细菌可通过血液循环到达泌尿系统引发感染。淋巴道感染： 盆腔和腹腔的感染可通过淋巴系统蔓延到泌尿系统。例如，患有阑尾炎时，细菌可能通过淋巴系统波及到泌尿系统，引起尿路感染，但这种情况比较罕见。
易感人群因素
女性： 女性由于生理结构的特殊性，尿道短、宽且直，靠近肛门，肛门周围的细菌容易侵入尿道，所以女性尿路感染的发生率比男性高很多。据统计，育龄女性一生中至少有一次尿路感染的概率较高。另外，绝经后的女性雌激素水平下降，局部抵抗力降低，也容易发生尿路感染。泌尿系统结构异常者： 比如患有尿路结石、先天性尿路畸形等疾病的人，尿液排出不畅，细菌容易在局部滋生繁殖，从而引发尿路感染。例如，尿路结石会阻碍尿液的正常流动，使尿液积聚，为细菌生长提供了有利环境。免疫力低下者： 像糖尿病患者，由于血糖高，尿液中含糖量高，有利于细菌生长；长期使用免疫抑制剂的人，身体免疫力下降，对细菌的抵御能力减弱，容易发生尿路感染。比如，一些器官移植术后的患者需要长期使用免疫抑制剂，他们发生尿路感染的风险就会增加。导尿或尿路器械检查者： 进行导尿操作或者尿道器械检查时，可能会损伤尿道黏膜，并且将外界细菌带入尿道，从而引发尿路感染。例如，留置导尿管超过3天的患者，尿路感染的发生率会明显升高，超过90%。