胆结石手术后可能出现一些后遗症，比如胆瘘，发生率大约在1%~5%左右。胆瘘是指胆汁通过异常通道流出，可能导致腹腔感染等问题。另外，还可能有消化不良的情况，部分患者在术后短期内会出现食欲减退、腹胀、腹泻等消化不良症状，这是因为胆囊切除后，胆汁的储存和排放模式改变，影响了脂肪的消化吸收，一般经过3~6个月的适应期可能会有所缓解，但也有部分人可能长期存在。
胆管损伤
医源性胆管损伤： 在胆结石手术中，有一定概率出现胆管损伤，这主要是手术操作过程中对胆管的误伤导致。比如在腹腔镜胆囊切除术中，由于解剖结构辨认不清等原因可能发生。胆管损伤后可能会引起黄疸、胆汁性腹膜炎等严重后果，需要进一步的手术修复等处理。自身胆管病变导致： 本身胆管存在病变，如胆管畸形等，也可能在手术中被遗漏或处理不当，进而出现胆管相关的后遗症。
胃肠道功能紊乱
短期影响： 术后早期胃肠道功能紊乱较为常见，患者可能出现恶心、呕吐等症状。这是因为手术对胃肠道有一定刺激，且胆囊切除后胆汁排放规律改变，影响了胃肠道的消化和蠕动功能。一般术后1~2天内可能会出现这种情况，随着身体恢复会逐渐缓解。长期影响： 部分患者可能长期存在胃肠道功能紊乱，表现为反复的腹胀、腹痛、腹泻等。这与胆汁持续不断地流入肠道，影响了肠道正常的消化酶平衡等因素有关。比如胆汁持续进入肠道，可能会破坏肠道内的菌群环境，导致肠道消化功能长期受到影响。
切口相关后遗症
切口感染： 胆结石手术切口如果发生感染，发生率大约在5%左右。尤其是一些肥胖患者、糖尿病患者等切口感染风险更高。切口感染会出现局部红肿、疼痛、渗液等症状，严重的可能需要抗感染治疗甚至二次清创等处理。切口瘢痕增生： 部分患者可能出现切口瘢痕增生，表现为切口处瘢痕隆起、变硬，影响美观，少数人可能会有瘙痒等不适症状。一般年轻患者、瘢痕体质患者发生切口瘢痕增生的概率相对较高。