呼吸暂停综合征的治疗方法主要包括一般治疗、无创气道正压通气治疗和手术治疗等。一般来说，轻度呼吸暂停综合征可以先尝试一般治疗，中重度可能需要结合其他方法。
一般治疗
生活方式调整： 患者要注意控制体重，体重超出正常范围的人，减重5% - 10%可能会使呼吸暂停的症状得到改善。同时，要避免睡前饮酒、服用镇静催眠药物等，因为这些因素可能会加重呼吸暂停的情况。另外，应采取侧卧位睡眠，侧卧位能减少上气道阻塞的概率。运动锻炼： 适当进行有氧运动，如每周坚持3 - 5次，每次30分钟左右的快走、慢跑等运动，有助于增强呼吸肌力量，改善呼吸功能，对呼吸暂停综合征有一定的辅助治疗作用。
无创气道正压通气治疗
持续气道正压通气（CPAP）： 这是治疗中重度呼吸暂停综合征最常用的无创通气方法。通过给患者佩戴一个面罩，在睡眠时提供一定压力的空气，保持气道通畅。一般根据患者的具体情况调整压力，压力范围通常在4 - 20厘米水柱之间。大多数患者经过规范使用CPAP后，呼吸暂停和低通气的次数会明显减少，睡眠质量也能得到改善。双水平气道正压通气（BiPAP）： 对于一些不能耐受CPAP或者有特定呼吸功能障碍的患者适用。它能提供不同的吸气压力和呼气压力，更符合生理需求，在改善通气方面可能有更好的效果，但费用相对CPAP会高一些。
手术治疗
腭咽成形术： 主要适用于因扁桃体肥大、软腭肥厚等导致上气道阻塞的患者。手术通过切除部分扁桃体、多余的软腭组织等，扩大上气道。不过，手术有一定的复发概率，一般术后需要患者继续保持健康的生活方式，而且并不是所有患者都能通过手术达到理想的治疗效果，大约有30% - 50%的患者术后症状能得到明显改善。下颌骨前移术： 针对因下颌后缩引起上气道狭窄的患者。手术将下颌骨向前移动，增加气道空间，从而改善呼吸暂停的情况。该手术的有效率大概在60% - 70%左右，但也存在一定的手术风险，如可能出现面部神经损伤等并发症。