中性粒细胞低可能由多种原因造成。比如感染因素，像病毒感染就比较常见，像流感病毒、风疹病毒等引起的感染，有研究显示约有30% - 50%的病毒感染患者会出现中性粒细胞降低的情况；细菌感染中，伤寒杆菌感染也常导致中性粒细胞减少。
血液系统疾病相关
造血干细胞疾病： 像再生障碍性贫血，患者的骨髓造血功能衰竭，会使得中性粒细胞生成减少。再比如急性白血病，白血病细胞在骨髓内大量增殖，抑制了正常造血干细胞的功能，从而导致中性粒细胞数量降低。骨髓增生异常综合征： 这是一组起源于造血干细胞的克隆性造血障碍疾病，骨髓中的造血细胞存在发育异常的情况，影响了中性粒细胞的正常产生，使得外周血中中性粒细胞计数下降。
药物因素导致
抗肿瘤药物： 很多化疗药物在杀伤肿瘤细胞的同时，也会对正常的造血干细胞产生抑制作用，从而引起中性粒细胞减少。例如环磷酰胺，它通过干扰DNA的合成来发挥抗肿瘤作用，但也会影响骨髓造血，导致中性粒细胞降低。抗甲状腺药物： 像甲巯咪唑，少数人服用后可能会出现骨髓抑制的不良反应，进而引起中性粒细胞减少。还有一些抗生素，如氯霉素，长期或大量使用时也可能抑制骨髓造血，导致中性粒细胞降低。
自身免疫性疾病影响
系统性红斑狼疮： 这是一种自身免疫性结缔组织病，患者体内的自身抗体攻击自身的造血系统，影响中性粒细胞的生成和存活，使得中性粒细胞数量降低。类风湿关节炎： 部分类风湿关节炎患者会出现免疫功能紊乱，自身抗体等因素会影响骨髓中中性粒细胞的生成，导致中性粒细胞减少的情况发生。