糜烂性胃炎的治疗药物需根据具体情况选择，通常会用到抑制胃酸分泌的药物等。一般来说，常用的抑制胃酸分泌药物有质子泵抑制剂，如奥美拉唑等，这类药物能有效减少胃酸对胃黏膜的刺激，可缓解糜烂性胃炎引起的不适症状。
抑制胃酸分泌类药物
质子泵抑制剂： 像奥美拉唑，它能特异性地作用于胃黏膜壁细胞，抑制胃酸分泌。一般来说，这类药物可有效减少胃酸对胃黏膜糜烂部位的刺激，促进糜烂面的修复。不过，孕妇、哺乳期妇女等特殊人群使用时需谨慎。H₂受体拮抗剂： 例如雷尼替丁，它能竞争性阻断组胺H₂受体，减少胃酸分泌。其作用强度比质子泵抑制剂稍弱一些，但也能在一定程度上缓解糜烂性胃炎导致的胃酸过多问题。
保护胃黏膜类药物
铝碳酸镁： 它可以中和胃酸，同时在胃黏膜表面形成一层保护膜，覆盖在糜烂处，防止胃酸、胆汁等对胃黏膜进一步损伤，还能吸附胆汁酸等，对糜烂性胃炎有较好的保护作用。一般来说，服用后能较快地缓解胃部不适。硫糖铝： 服用后在胃内可形成一种保护性的薄膜，附着在胃黏膜糜烂部位，保护胃黏膜免受胃酸等的侵蚀，促进糜烂组织的修复。不过，肾功能不全者长期大量服用可能会有铝蓄积的风险，需注意。
根除幽门螺杆菌类药物
如果糜烂性胃炎是由幽门螺杆菌感染引起的，通常需要进行根除幽门螺杆菌治疗，会采用联合用药方案。一般是质子泵抑制剂（如奥美拉唑）+铋剂（如枸橼酸铋钾）+两种抗生素（如阿莫西林、克拉霉素）。例如，阿莫西林是常用的抗生素，它可以抑制细菌细胞壁的合成，从而起到杀菌作用，但对青霉素过敏者不能使用。而克拉霉素也能抑制细菌蛋白质的合成来发挥抗菌作用，不过部分人服用后可能会出现胃肠道不适等不良反应。