脸上长黑疣，通常是由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起的，尤其是低危型HPV。比如常见的寻常疣，就可能出现在脸部，它是HPV-2型等感染所致。
病毒感染因素
HPV直接感染： HPV是一种嗜上皮性病毒，当皮肤黏膜有微小破损时，HPV就容易侵入上皮细胞内，进而增殖、分化，导致上皮细胞异常增生和分化，从而形成黑疣样的损害。不同亚型的HPV感染会导致不同表现的疣体，像HPV-1型等可能更易引发面部的一些疣状病变。
自身免疫因素
免疫力低下人群易患： 当人体免疫力较低时，比如长期劳累、患有某些慢性疾病（如糖尿病等）、长期使用免疫抑制剂等情况，身体对HPV的清除能力下降，就更容易感染HPV从而长黑疣。例如，一些长期熬夜、作息不规律的人，免疫力相对较弱，相比免疫力正常的人，脸上长黑疣的几率可能会高一些。
接触传染因素
直接或间接接触传播： 直接接触是指与长有黑疣的人直接接触，比如握手等近距离接触，可能会导致病毒传播。间接接触则是接触了被HPV污染的物品，像共用毛巾、脸盆等，也有可能感染HPV进而长黑疣。比如在公共浴室、游泳馆等场所，如果接触了被污染的物品，就存在感染风险。