九价人乳头瘤疫苗可以预防由人乳头瘤病毒（HPV）16、18、31、33、45、52、58型引起的相关疾病。其中，HPV16和18型可导致约70%的宫颈癌，其他型别则与约90%的肛门癌、外阴癌、阴道癌及90%的尖锐湿疣相关。
预防宫颈癌方面
预防高危型HPV引发的宫颈癌： 九价HPV疫苗能有效预防由HPV16、18型等高危型别引起的宫颈癌。大量临床研究数据表明，接种九价HPV疫苗后，针对这几种高危型HPV的抗体阳转率较高，能显著降低感染相关高危型HPV进而发展为宫颈癌的风险。一般来说，在未感染相关型别HPV之前接种，预防效果更好。预防癌前病变： 除了宫颈癌，九价HPV疫苗还能预防由高危型HPV导致的宫颈上皮内瘤变（CIN2、CIN3）等癌前病变。这些癌前病变若不及时干预，可能会进一步进展为宫颈癌。
预防其他相关疾病方面
预防肛门癌： 九价HPV疫苗对预防由高危型HPV引起的肛门癌有作用。研究发现，接种九价HPV疫苗后，能降低感染相关HPV进而引发肛门癌的可能性。有性行为的人群接种后，对肛门癌的预防也能起到一定保护作用。预防外阴癌和阴道癌： 对于由高危型HPV导致的外阴癌和阴道癌，九价HPV疫苗同样有预防效果。它可以减少相关HPV型别在外阴和阴道部位的感染，从而降低患上外阴癌和阴道癌的风险。预防尖锐湿疣： 九价HPV疫苗对预防尖锐湿疣也有一定作用。尖锐湿疣主要是由低危型HPV中的6型和11型等引起，九价HPV疫苗包含了6型和11型，能预防这两种型别引起的尖锐湿疣。不过，它不能预防所有导致尖锐湿疣的HPV型别，但对常见的相关型别也能起到预防作用。