肛门坠胀引起两边臀部酸痛可能由多种疾病导致，具体如下：
一、直肠粘膜脱垂：这主要是由于肛门括约肌松弛引起。会有红色柔软环状物出现在肛门周围，常伴有肛门失禁、便秘、肛门肿胀下坠感以及两边臀部酸痛等表现。治疗上，一般多采用手术方法，如：
1.硬化剂注射：可帮助改善脱垂情况。
2.直肠悬吊固定术：能有效固定直肠位置。
3.直肠切除术：对于严重情况适用。
二、肛窦炎：由肛门隐窝内细菌反复感染导致。患者不仅会有肛门括约肌紧张痉挛而出现肛门坠胀疼痛以及两边臀部酸痛的感觉，若不积极治疗，还极易形成肛周脓肿甚至肛瘘等疾病。建议可进行如下治疗：
1.肛窦切开引流：能缓解炎症。
2.配合热水和高锰酸钾溶液坐浴疗法：起到清洁和舒缓作用。
3.积极服用阿莫西林胶囊、头孢克洛片、阿奇霉素片等药物：以抗菌消炎。
三、内痔：多因内痔部分脱出，长时间脱出后出现缺血、水肿、感染，进而引发肛门肿胀下坠感以及两边臀部酸痛症状。内痔的治疗如下：
1.无症状的内痔一般无需治疗。
2.偶尔有大便带鲜血或肛门坠胀不适，大便后临睡前可用高锰酸钾化水坐浴清洗肛门，将痔疮药膏挤入肛门内治疗，通常症状可消除。
3.有内痔脱出肛门现象，可局部涂抹润滑油，通过手法复位还纳肛内解除症状。
4.严重时可行内痔套扎术或内痔硬化剂注射术，效果较好。
四、肛周脓肿：是肛管周围的软组织或周围间隙发生急性化脓性感染并形成脓肿。属于感染性疾病，主要表现为感染症状，全身症状一般不明显，但若出现脓毒血症会表现为寒颤、高热、低血压等全身感染症状，同时伴有肛门坠胀引起两边臀部酸痛。对于肛周脓肿的治疗方式有：
1.早期脓肿未完全化脓，可口服或静脉使用消炎药，如头孢克洛片、甲硝唑片、盐酸左氧氟沙星片等，同时应用红霉素软膏。
2.若脓肿已化脓且有波动感，使用消炎药无效，需手术治疗，即手术切口引流。
总之，当出现肛门坠胀引起两边臀部酸痛时，应尽快明确病因，以便采取针对性的治疗措施。