亚急性甲状腺炎常见症状有甲状腺部位疼痛，一般疼痛可从一侧开始，很快向其他部位放射，疼痛程度不一，有的患者疼痛较剧烈，可持续数天至数周。通常在发病前1~3周有上呼吸道感染病史。
全身症状表现
患者常伴有全身不适、乏力、肌肉疼痛，部分患者还会出现发热，体温一般在38℃左右，少数可达到39℃以上，发热可持续数天至2~3周。
甲状腺局部症状
甲状腺肿大： 甲状腺可呈轻至中度肿大，多为双侧对称，也可一侧较明显。肿大的甲状腺质地较硬，有触痛。比如有的患者能摸到甲状腺部位有肿块，且按压时疼痛明显。甲状腺功能异常表现： 疾病早期，由于甲状腺滤泡被破坏，甲状腺激素释放进入血液，可出现甲亢症状，如心慌、手抖、多汗、食欲亢进但体重减轻等；随着病情发展，甲状腺激素消耗殆尽，可能出现甲减表现，如怕冷、乏力、水肿、便秘等，但这种甲减一般是暂时性的，多数患者甲状腺功能可逐渐恢复正常。
其他可能伴随症状
有的患者可能伴有颈部淋巴结肿大，不过淋巴结肿大一般不明显。另外，部分患者在吞咽时颈部疼痛会加重，影响正常进食。