宝宝有时摇头可能是由以下原因引起的：
1.正常的生理现象：宝宝摇头可能是一种自我安慰的行为，类似于吮指、抓耳等。这种摇头通常是无意识的，不会对宝宝的健康造成影响。
2.皮肤问题：宝宝的头部可能会出现湿疹、痱子等皮肤问题，导致瘙痒，从而引起摇头。此外，宝宝的头发过长、过厚，也可能会使头部不适，引起摇头。
3.耳部问题：耳部感染、耳屎过多等耳部问题可能会引起宝宝耳部不适，导致摇头。此外，宝宝在吃奶时，乳汁可能会流入耳部，引起耳部疼痛，也会导致摇头。
4.神经系统问题：如果宝宝的摇头伴随着其他异常症状，如抽搐、意识不清等，可能是神经系统问题引起的，如癫痫、脑瘫等。这种情况需要及时就医，进行进一步的检查和治疗。
5.缺钙：宝宝缺钙可能会导致神经兴奋性增加，出现多汗、摇头、夜惊等症状。此外，缺钙还可能会影响宝宝的骨骼发育，导致方颅、鸡胸等畸形。
6.其他：宝宝摇头还可能与环境因素、情绪因素等有关。如果宝宝周围环境过热、过吵，或者宝宝感到无聊、紧张等，也可能会出现摇头的现象。
如果宝宝只是偶尔摇头，且没有其他异常症状，家长可以先观察一段时间。如果宝宝摇头的频率较高，或者伴有其他异常症状，建议及时就医，进行相关检查，以确定具体原因。