肛门湿疹可以使用的药膏种类较多，一般来说糖皮质激素类药膏效果较为显著，比如氢化可的松乳膏，它能快速减轻炎症、瘙痒等症状，但连续使用不宜超过2-3周。
糖皮质激素类药膏
丁酸氢化可的松乳膏： 属于中效糖皮质激素，局部外用可抗炎、抗过敏、止痒。适用于肛门湿疹急性期，能有效缓解红肿、瘙痒症状。使用时要注意避免用于皮肤破溃处，儿童使用需在成人监护下。糠酸莫米松乳膏： 为局部外用糖皮质激素，具有抗炎、抗过敏、止痒及减少渗出作用。对于肛门湿疹有较好的治疗效果，一般每天使用1次，使用时要注意避免长期大面积使用。
钙调磷酸酶抑制剂
他克莫司软膏： 非激素类抗炎药，适用于成人肛门湿疹，尤其适合面部、颈部等皮肤薄嫩部位及糖皮质激素治疗效果不佳的患者。使用初期可能会有局部灼热感，一般会逐渐消失。吡美莫司乳膏： 同样属于钙调磷酸酶抑制剂，可短期或长期间歇性治疗轻度至中度肛门湿疹。使用时要避免接触眼睛等黏膜部位。
中药成分药膏
除湿止痒软膏： 由蛇床子、黄连、黄柏、白鲜皮等中药组成，具有清热除湿、祛风止痒的功效。对肛门湿疹有一定疗效，使用时外用，涂于患处，一日3-4次。孕妇慎用。青鹏软膏： 由棘豆、亚大黄、铁棒锤等中药组成，能止痛消肿。可用于肛门湿疹引起的肿痛等症状，外用，适量涂于患处，一日2次。对本品过敏者禁用。